Do you know what this is? 「これはなんだか知っていますか？」などの答えが、Yes または Noで答えられる一般疑問文と What do you think this is? 「これは何だと思いますか？」などの答えがYes や Noで答えられない特殊疑問文があります。
Do you know + 疑問詞 ～?型は主節の動詞がknow、tell、understandなどの場合で、答えがYes または Noで答えることができます。
疑問詞 + do you think ～?型は主節の動詞がthink、suppose、believe、imagine、sayなどの場合です。注意が必要なのはwhat、who、whichなどが間接疑問文の主語の場合、主節の動詞thinkなどのすぐ後ろに間接疑問文の動詞や助動詞が続きます。
Which team do you think will win? 「どっちのチームが勝つと思いますか？」
Who do you think did it? 「誰がそれをやったと思いますか？」